clustal w 进行多序列比对超500条寻列,该如何比对?利用程序Clustal W比对全部的EST,根据相似性程度,删除冗余的EST.EMBL限制只可以500条比对,我的数据是2000多EST,比对成功后又怎么去剔除?

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/04/28 21:02:08
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clustal w 进行多序列比对
超500条寻列,该如何比对?
利用程序Clustal W比对全部的EST,根据相似性程度,删除冗余的EST.EMBL限制只可以500条比对,我的数据是2000多EST,比对成功后又怎么去剔除?

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可能这是网页版的局限,我也没有同时比过这么多的序列.
但是我想你用线下的MEGA软件就应该不会有数量的限制了.
www.megasoftware.net/
去下载一个mega,然后本地比对,比在线比对要快多了,而且操作性也更好.

clustal w 进行多序列比对超500条寻列,该如何比对?利用程序Clustal W比对全部的EST,根据相似性程度,删除冗余的EST.EMBL限制只可以500条比对,我的数据是2000多EST,比对成功后又怎么去剔除? 如何进行两蛋白质序列比对? 如何往clustal中加入序列 怎样进行基因组中基因功能相似的多条基因序列进行多序列比对? 序列比对 测序结果回来了 怎么进行序列比对,用什么软件 如何从系统发育树或者CLUSTAL比对结果中看出核酸之间的差异性? 请问如何使用blast进行多序列两两比对 16S rRNA怎样进行序列分析比对 如何使用DNAMAN软件进行多重序列比对 运用ClustalX进行多序列比对在导入序列时常出现的问题都有那些呢?现在我正在设计引物运用ClustalX进行多序列比对找保守序列但怎么也导入不了序列老提示说是格式不正确,具体都用什么形式 克隆未知基因的序列,测序后BLAST进行了比对,是我们想要的序列,接下来对序列还要进行什么分析? 我要做一个系统树,序列是从NCBI上粘贴下来的,但是word和txt格式无法Clustal比对,有高人能指点一下么?我对NCBI用的也不是很熟,能帮我一下这个的用法就更好了~ 基因多重序列比对 在Blast里面进行序列比对,相似度主要看哪个值 怎样将番茄的成熟miRNA进行序列自我比对 如何在NCBI中进行基因序列比对,比如小鼠p53基因与人类p53基因的比对 想问下各位高人,设计引物时没有所找物种的基因序列,想问下怎么进行多物种序列比对,找到相对保守区域呢希望各位能给与详细指导,谢谢大家 双序列比对和多序列比对,哪种方法更能揭示蛋白质功能相关的保守序列片段?为什么?